Существует общий регламент регистрации ИП через МФЦ, но вполне возможно, что конкретный центр по какой-то причине (возможно, нехватка специалистов этого профиля или сложности при документообороте с ФНС) пока не оказывает такие услуги.
Заставить, разумеется, нельзя, надо просто обратиться в другой МФЦ вашего региона. Для этого можно обратиться на горячую линию (телефон вам должны дать в центре). Если МФЦ, который услугу по регистрации ИП оказывает, находится от вас далеко, возможно, лучше обратиться уже в саму регистрирующую инспекцию.