Здравствуйте!
ЭТК лишь отражает данные о Вас в системе персонифицированного учета. Эти сведения поступают в СФР от работодателей. При увольнении работника, в том числе генерального директора, работодатель должен оформить прекращение трудового договора и подать в СФР сведения по форме ЕФС-1. Только в этом случае данные отразятся в ЭТК автоматически.
Вам нужно было оформить свое увольнение с должности гендира до исключения ООО из ЕГРЮЛ и передать сведения в СФР от имени организации. После ликвидации ООО сделать это самостоятельно уже невозможно, поскольку работодателя больше нет. СФР также не может внести сведения о вашем увольнении в свою систему только на основании того, что ООО исключено из ЕГРЮЛ.
В такой ситуации необходимо обратиться в суд с заявлением об установлении факта прекращения трудовых отношений с ООО. Решение суда будет подтверждать дату расторжения Вашего договора с организацией и послужит основанием для внесения сведений об увольнении в систему СФР. После этого запись об увольнении отразится в ЭТК.