В нашем образце Р14001 действительно не заполнены пункты - 3,4,5. Причина в том, что для адресов Москвы (это видно по региону 77) и Питера в регистрационных формах не указывают город, район, населенный пункт. Это указание Приказа ФНС России от 25 января 2012 г. N ММВ-7-6/25@. Для остальных населенных пунктов эти пункты заполняются.