При уменьшении налогового платежа на УСН не имеет значения, за какой год начислены взносы. Если в 2017 году вы уплатили взносы за 2016 год (в том числе дополнительный 1% взнос), то вы можете их учитывать при уменьшении налога, начисленного в 2017 году. Однако, учитывая, что взнос уплачен в 1 квартале, вы не можете уменьшать на эту сумму авансовый платеж за 9 месяцев, а только остаток налога по итогам года. Если у вас получится переплата (все взносы превысят сумму налоговых платежей), то на эту разницу надо писать заявление о зачете или возврате излишне уплаченной суммы налога. Сделать это можно только после сдачи декларации за 2017 год.