Здравствуйте! Мы полагаем, что директор российской организации должен физически находиться в РФ. Если человек постоянно находится в РБ, то быть директором российского ООО он не может. Варианты решения – либо владельцу ООО зарегистрироваться в РФ согласно требованиям закона (если он планирует фактически находиться в России), либо нанять на должность директора другое лицо. Иначе не миновать разного рода сложностей, с первой из которых компания уже столкнулась - невозможность получить ИНН и открыть р/сч.
Организация в России регистрируется по адресу находения ее исполнительного органа - директора (п. 2 ст. 54 ГК РФ, п. 2 ст. 8 закона от 08.08.2001 № 129-ФЗ). Предполагается, что по этому адресу директор работает или живет. Привязка компании к адресу директора нужна ФНС для того, чтобы с ним всегда можно было связаться.
Если директор работает за пределами России, получается, исполнительный орган находится не по тому адресу, который указан в ЕГРЮЛ. Это нарушение, и оно может стать причиной штрафа 5-10 тыс. рублей по ч. 4 ст. 14.25 КоАП, а в перспективе привести к принудительной ликвидации ООО.
Чтобы не нарушать закон, Минфин рекомендует даже вносить изменение в ЕГРЮЛ, если директор отправляется на удаленку (письмо Минфина России от 29.05.2019 № 03-12-13/38956). Но речь, конечно, про удаленку в России.
Добавим, что организация самостоятельно несет ответственность за то, чтобы в ЕГРЮЛ отражалась достоверная и актуальная информация. Даже если сейчас ФНС поставила ООО на учет с директором без адреса (полагаем, в период разрешенного пребывания без регистрации), это не помешает ей потом наложить на компанию штраф.