Судя по вашему вопросу, на момент изменения устава в обществе есть только один участник. Соответственно, о решении общего собрания речь не идет. Второй участник получит свои права только после того, когда запись о нем будет внесена в ЕГРЮЛ, то есть после регистрации изменений в ИФНС. Поэтому новая редакция устава в вашем случае утверждается единственным участником.