Нет, не имели. Дело в том, что взносы учитываются только в том периоде, когда были уплачены. Фиксированные взносы вы учли правильно, потому что заплатили их до конца 2016 года. А 1%, уплаченный в марте, уже не имеет отношения к платежам 2016 года, хотя они и были рассчитаны с дохода, полученного в 2016 году.
То есть, вам надо доплатить налог за 2016 до 30 апреля, а сумму в 1% вы можете вычесть из авансового платежа за 1 квартал 2017 года.