Нет, налог с зарплаты ИП не платят, да и, в принципе, понятие зарплаты к предпринимателям неприменимо. Весь получаемый от бизнеса доход является собственностью физического лица. "При переводе денег с расчетного счета на свои нужды надо так и писать: Перевод на собственные нужды физического лица".
Но даже если вы неверно указали назначение платежа (указав выплату зарплаты), это просто ошибка, которая не влияет на обязанность платить налог.