Госпошлины за лицензии не входят в единый налоговый платеж (абз. 3 и 4 п. 1 ст. 58 НК РФ). Значит, заполняем платежку по правилам не для ЕНП, то есть с указанием конкретного КБК.

На промосайте ФНС в перечне КБК для госпошлин за совершения действий, связанных с лицензированием, указан КБК 18210807081010300110 — его вписываем в поле 104. В поле 105 указываем ОКТМО по месту учета. В поле 101 «Статус плательщика» указываем код 01, поскольку госпошлина в ЕНП не входит, а плательщик заполняет платежку не вместо уведомления по ЕНП.
https://www.nalog.gov.ru/rn77/ens/

Проще всего заполнить платежку в сервисе ФНС - https://service.nalog.ru/payment/gp.html?payer=ul.