Здравствуйте, после регистрации ООО по домашнему адресу квартира остается вашей собственностью, как частного лица, и не меняет своего характера жилой площади. Вы можете сдавать эту квартиру, но есть вероятность споров с налоговой при выявлении этого факта.
Вы должны будете доказать, что продолжаете находится в этой квартире как единоличный исполнительный орган ООО. Если в договоре найма квартиры будет прописано, что вы не имеете права входить в нее без предупреждения и согласия нанимателей, это будет проблематично.
Доходы от сдачи квартиры к ООО отношения не имеют, вы должны будете выплачивать подоходный налог с них 13% или зарегистрировать ИП с таким видом деятельности и перейти на спецрежим, например, УСН Доходы 6%.