Добрый день, по нашему мнению, лицензия на пассажироперевозки до приобретения патента не требуется. Такой вывод сделан, исходя из того, что в статье 346.43. НК РФ наличие лицензии перед приобретением патента оговаривается только для занятия медицинской (фармацевтической) и частной детективной деятельностью. В отношении перевозок это требование не установлено, поэтому ИФНС не может вам отказать в выдаче патента по причине отсутствия лицензии.
Рекомендуем до получения патента обратиться в лицензирующий орган, чтобы убедиться в том, что вы сможете выполнить требования для получения лицензии. Кроме того, учитывайте, что при подаче заявления на патент надо указать точные идентификационные сведения о каждой единице транспорте, поэтому стоит узнать, удовлетворяет ли конкретный транспорт условиям выдачи лицензии.