Пенсионный налог, а точнее страховые взносы в ПФР участники ООО за себя, в отличие от ИП, не платят, только за своих работников.
Что касается системы налогообложения, то деятельность платежного агента является посреднической, по типу агентской. В этом случае можно применять УСН Доходы, УСН Доходы минус расходы и ОСНО.
Наиболее выгодный режим для вас надо подбирать индивидуально, с расчетом конкретной налоговой нагрузки. Рекомендуем получить для этого бесплатную налоговую консультацию https://www.regberry.ru/Besplatnaya-konsultatsiya-po-nalogooblozheniyu